
Od 1973 roku inwazja kosmitów znana jako BETA na Ziemię doprowadza cywilizację ludzką do niemal upadku. Stawiając czoła ogromnej masie sił wroga, ludzkość opracowała duże humanoidalne ramiona zwane Taktycznymi Myśliwcami Powierzchniowymi i rozmieściła je na swoich liniach obronnych na całym świecie. Jednak wszystkie te wysiłki mogą spowolnić porażki, ale nie mogą powstrzymać BETA, a ludzkość zmuszona jest do opuszczenia większego obszaru kontynentu euroazjatyckiego. Od 30 lat ludzkość ugrzęzła w niekończącej się wojnie z BETA bez nadziei na zwycięstwo. W 2001 roku Cesarska Japonia boryka się z trudnościami w opracowaniu głównych Taktycznych Myśliwców Powierzchniowych nowej generacji (TSF), broniących linii frontu Dalekiego Wschodu. ONZ zaproponowała wspólny program rozwoju między Cesarską Japonią a Stanami Zjednoczonymi w ramach swojego międzynarodowego projektu wzajemnego rozwoju TSF, Projektu Prominence. Yui Takamura, pilot nawodny Cesarskiej Gwardii Królewskiej Japonii, otrzymuje odpowiedzialność za pprojekt i wyrusza na Alaskę. Tymczasem Yuya Bridges, również pilot nawodny armii amerykańskiej, zmierzał w to samo miejsce. Nie spodziewali się jednak, że ich spotkanie drastycznie zmieni ich przeznaczenie. Ta historia z ekscytującymi ludzkimi dramatami i działaniami robotów ma miejsce podczas opracowywania nowych taktycznych myśliwców powierzchniowych, najważniejszej i najskuteczniejszej broni przeciwko BETA, w obliczu kryzysu wyginięcia ludzkości. (Źródło: oficjalna angielska witryna internetowa Muv-Luv Total Eclipse)