Dawno temu na wyspie zwanej Altomare żyli stary mężczyzna i kobieta. Pewnego dnia małżeństwo znalazło dwójkę małych dzieci leżących na brzegu, ciężko rannych. Małżeństwo przyjęło je i zaopiekowało się nimi, a dzieci szybko wyzdrowiały. Ale wtedy wyspa została zaatakowana przez potwory. W ciągu kilku chwil wyspa wpadła w gniew potworów. Ale wtedy... Na oczach starca i pani dzieci, którymi się opiekowali, przekształciły się w Pokemony Eona, Latios i Latias. Wezwali swoją rodzinę z nieba. Przybyli i zabrali ze sobą kamień zawierający moc odpędzania potworów. Klejnot ten był znany jako „Rosa Duszy”. Na wyspę powrócił pokój. Jednak później w teraźniejszości kryminalny duet - Zannâ i Rion - szuka Latios i Latias, aby przejąć kontrolę nad Soul Dew. Robiąc sobie krótką przerwę w Altomare, Satoshi zaprzyjaźnia się z Latiasem i teraz zostaje wciągnięty w sytuację, która pomaga ocalić Altomare przed ponownym pochłonięciem przez zniszczenie. (Kwaśnyce: Anime News Network)