
Kilka lat po przygodach Wybranych Dzieci w Cyfrowym Świecie, nowa partia Wybranych Dzieci zostaje wezwana, aby ocalić Cyfrowy Świat. Zły władca znany jako Digimon Kaiser lub Digimon Imperator zmusza Digimony Cyfrowego Świata do zniewolenia. Nowa grupa Wybranych Dzieci, z pomocą swoich Digimonów, rozpoczyna podróż mającą na celu powstrzymanie złego Imperatora Digimonów.