
Minęło tysiąc lat, odkąd Gauna, dziwna obca rasa bez znanej metody komunikacji, zniszczyła Układ Słoneczny. Części ludzkości udało się uciec, korzystając z ogromnych „statków nasiennych”, takich jak Sidonia, które pozwoliły im utrzymać populację podczas dryfowania w kosmosie. Nagate Tanikaze to młody człowiek wychowany głęboko w głębi statku. Kiedy rozpoczyna szkolenie na pilota ogromnej broni robotycznej znanej jako Gardes, Nagate otrzymuje zadanie pilotowania legendarnej jednostki znanej jako Tsugumori. Nagate i jego koledzy piloci narażają życie przeciwko Gaunie w ostatecznej bitwie o przetrwanie ludzkości! (Źródło: AniDB)